一楼：服务台、挂号收费窗口、检验科、抽血室、普外科、骨科、甲乳外科、胸外科、脑外科、泌尿外科、知名专家门诊、神经内科、消化内科、心血管内科、内分泌科、呼吸内科、血液肿瘤内科、肾内科、老年科门诊、儿科、儿科雾化室
二楼：妇产科、口腔科、口矫科、耳鼻咽喉头颈外科、中药房、西药房
三楼：超声医学科、眼科专家门诊、眼科
四楼：专病门诊、中医专家门诊、康复中医科门诊、针灸门诊、内窥镜室、出入院管理科、门诊部
五楼：手术室、脑电图、肺功能、TCD室、换药室
六楼：信息科、药剂科
七楼：临床技能培训中心
八楼：图书室
九楼：病案室
十楼、十一楼：药库
十二楼：档案室
皖南医学院第二附属医院附近公交/地铁公交：皖医二附院(9路; 12路; 27路; 108路)
康复路(9路; 12路; 27路; 108路)
东外街(1路; 17路; 32路; 41路; 46路)
